Οι αλλεργίες οφείλονται στην υπερβολική, και κατ' επέκταση επιβλαβή για τον οργανισμό αντίδραση του ανοσοποιητικού συστήματος στα αλλεργιογόνα.
Πρόκειται συνήθως για πρωτεΐνες που σε ένα φυσιολογικό άνθρωπο δεν προκαλούν καμία αντίδραση, σε ένα όμως αλλεργικό είναι υπεύθυνα για την εκδήλωση αλλεργικών συμπτωμάτων.
Αυτά εξαρτώνται από το είδος του αλλεργιογόνου.
Έτσι η αναπνευστική αλλεργία οφείλεται σε αλλεργιογόνα που βρίσκονται στην ατμόσφαιρα, η τροφική αλλεργία σε τροφικά αλλεργιογόνα, η δερματική αλλεργία σε αλλεργιογόνα που έρχονται σε επαφή με το δέρμα κλπ.